Przede wszystkim to właśnie w tym muzeum znajdują się pamiątki z jedynego pobytu Jana Pawła II na terenie naszej diecezji w Gorzowie 2 czerwca 1997 r. Jest księga liturgiczna z pielgrzymki do Polski w 1997 r., czerwona stuła z wizerunkiem Pani Rokitniańskiej i Męczenników Międzyrzeckich, w której Papież odprawiał nabożeństwo Liturgii Słowa w Gorzowie Wlkp., zdjęcia z jego pobytu w Gorzowie oraz tryptyk upamiętniający wizytę Papieża w diecezji zielonogórsko-gorzowskiej.
Muzeum posiada też kilka elementów stroju papieskiego: sutannę, piuskę i buty, w których chodził Jan Paweł II, oraz ornat, w którym przewodniczył Mszy św. Krzyżma w Bazylice św. Piotra w Rzymie w Wielki Czwartek 1987 r.
Dzięki zapobiegliwości bp. Józefa Michalika do muzeum w Rokitnie trafiło też wiele darów, które Jan Paweł II otrzymywał podczas wizyt apostolskich do różnych krajów świata. Są więc m.in.: biały ornat i mitra ofiarowane przez prezydent Filipin, pastorał z pielgrzymki do Meksyku 11 maja 1990 r., ornat misyjny z kompletem bielizny kielichowej i dekoracji liturgicznych ofiarowane Ojcu Świętemu podczas pielgrzymki do Ugandy, figura św. Piotra będąca darem dla Jana Pawła II od katolików z Chin, figura Matki Bożej z Medjugorie, figura Matki Bożej będąca darem od wiernych archidiecezji Luluabourg z Republiki Demokratycznej Konga, figura Matki Bożej ofiarowana Janowi Pawłowi II w Kamerunie, figura Świętej Rodziny ofiarowana Ojcu Świętemu przez pielgrzymów włoskich, kryształ górski z herbem papieskim upamiętniający wizytę Jana Pawła II w Niemczech, taca ofiarowana Papieżowi przez polskich pielgrzymów podczas pielgrzymki do Maroka 11 października 1982 r., figura Matki Bożej Fatimskiej objawiającej się dzieciom wykonana z gliny w darze dla Ojca Świętego Jana Pawła II, a także figura Matki Bożej z Zairu ofiarowana przez Jana Pawła II bp. Józefowi Michalikowi 7 stycznia 1990 r.
W muzeum znajduje się także cegła pochodząca z Drzwi Świętych Bazyliki św. Piotra w Rzymie otwieranych tylko na Rok Jubileuszowy. Była ona użyta przez Pawła VI do zamurowania drzwi w 1975 r. Następnie została wyjęta przez Jana Pawła II 25 marca 1983 r. - na rozpoczęcie Roku Świętego (1950 lat od śmierci Chrystusa). Ciekawym eksponatem jest lampa nocna wykonana z muszelek używana przez kard. Karola Wojtyłę w Kurii Biskupiej przy ul. Franciszkańskiej 3 w Krakowie. Jest także mała kolekcja medali, zaś poza budynkiem muzeum w sejfie zamknięty jest też bardzo prosty kielich mszalny, w którym Jan Paweł II odprawiał Mszę św.
Obecność tylu pamiątek po Janie Pawle II w Muzeum Rokitniańskim ma swoje uzasadnienie. Pamiętajmy, że po pierwsze Jan Paweł II poświęcił koronę Matki Bożej Rokitniańskiej, a prócz tego obok cudownego obrazu są jeszcze dwa przedmioty od niego pochodzące. Po lewej stronie znajduje się piękna róża, którą jako dar od Ojca Świętego z okazji koronacji obrazu Pani Cierpliwie Słuchającej w czerwcu 1989 r. przywiózł z Watykanu ks. prał. Michele Basso. Po drugiej stronie znajduje się srebrny różaniec, będący darem Ojca Świętego przywiezionym z Watykanu przez bp. Michalika. W muzeum jest też kopia obrazu Matki Bożej Cierpliwie Słuchającej z własnoręcznym podpisem Jana Pawła II i datą koronacji wizerunku.
Niewątpliwie część spośród pamiątek po Janie Pawle II przechowywanych w Rokitnie po beatyfikacji należałoby uznać za relikwie. Warto o tym pomyśleć, zwiedzając rokitniańskie muzeum.